Acelerando simulações de MD com GPUs NVIDIA

A computação de GPU tem sido amplamente usada para acelerar simulações intensivas em computação e ultrapassar os limites da descoberta. A plataforma multinúcleo da GPU NVIDIA® Tesla® fornece a potência computacional que supera em muito a da CPU típica. Cientistas e desenvolvedores podem acessar o desempenho da escala do supercomputador para executar sistemas posteriores, mais sistemas ou prazos mais longos de simulação.

Os sistemas molecular e de fase condensada são de natureza dinâmica; portanto, analisar seus movimentos no nível molecular e atomístico é essencial para entender os principais fenômenos físico-químicos. Durante décadas, houve um grande interesse em modelar os aspectos dinâmicos de vários sistemas, tanto nas ciências da vida quanto nas ciências dos materiais. Tais sistemas incluem complexos proteína-ligante, pequenas moléculas em solventes mistos, sólidos orgânicos e complexos macromoleculares sintéticos. A simulação da dinâmica molecular (MD) é a ferramenta computacional fundamental para capturar eventos dinâmicos de interesse científico em todas essas aplicações.

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