AMBER 18 está isponível em soluções Scherm.
O pacote AMBER 18 se baseia no AmberTools18 adicionando o programa pmemd, que se assemelha ao código sander (dinâmica molecular) do AmberTools, mas fornece melhor desempenho em várias CPUs e melhorias drásticas de velocidade nas GPUs.
Principais novos recursos incluem
- Cálculos de energia livre em GPUs
- Suporte de GPU para potenciais de íons 12-6-4
- Decomposição de domínio para paralelismo de CPU
- Cálculos de faixa elástica ajustados para pmemd (implementação de CPU e GPU parcial)
- Cálculos de potencial redox constante, para complementar simulações de pH constantes
- Suporte e melhorias significativas de desempenho para as mais recentes GPUs
- Maxwell, Pascal e Volta da NVIDIA.
- Novo código pmemd.gem para campos de força avançados, incluindo AMOEBA